Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SPIDRQ14159 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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SPIDRQ14159 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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SPIDRQ14159 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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SPIDRQ14159 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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SPIDRQ14159 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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SPIDRQ14159 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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SPIDRQ14159 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPIDRQ14159 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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