Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CKAP5Q14008 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CKAP5Q14008 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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