Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ITGA7Q13683 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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