Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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CDH18Q13634 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CDH18Q13634 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH18Q13634 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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