Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MSLNQ13421 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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