Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP3B2Q13367 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms