Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATMQ13315 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATMQ13315 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATMQ13315 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATMQ13315 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATMQ13315 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATMQ13315 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATMQ13315 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATMQ13315 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATMQ13315 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATMQ13315 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATMQ13315 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATMQ13315 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATMQ13315 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATMQ13315 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATMQ13315 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATMQ13315 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATMQ13315 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATMQ13315 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATMQ13315 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATMQ13315 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATMQ13315 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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