Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCGB2A2Q13296 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms