Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTP4A2Q12974 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTP4A2Q12974 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms