Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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