Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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TP53BP1Q12888 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TP53BP1Q12888 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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TP53BP1Q12888 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TP53BP1Q12888 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TP53BP1Q12888 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TP53BP1Q12888 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TP53BP1Q12888 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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TP53BP1Q12888 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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TP53BP1Q12888 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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TP53BP1Q12888 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP53BP1Q12888 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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