Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TGM3Q08188 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms