Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LRP1Q07954 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 658.3 ms