Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEUP1Q05D60 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEUP1Q05D60 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms