Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP7AQ04656 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP7AQ04656 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms