Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRB3Q04118 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms