Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPEQ02224 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms