Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC6A3Q01959 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC6A3Q01959 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms