Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP2C1P98194 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2C1P98194 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms