Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX1P78337 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX1P78337 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX1P78337 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX1P78337 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX1P78337 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX1P78337 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX1P78337 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX1P78337 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX1P78337 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX1P78337 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX1P78337 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX1P78337 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX1P78337 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX1P78337 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX1P78337 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX1P78337 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX1P78337 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX1P78337 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX1P78337 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX1P78337 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX1P78337 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX1P78337 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX1P78337 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX1P78337 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms