Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SUMO1P63165 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SUMO1P63165 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms