Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UFM1P61960 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
UFM1P61960 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
UFM1P61960 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
UFM1P61960 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UFM1P61960 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UFM1P61960 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UFM1P61960 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms