Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVK-21P61565 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms