Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RAB4BP61018 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RAB4BP61018 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RAB4BP61018 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RAB4BP61018 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RAB4BP61018 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RAB4BP61018 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RAB4BP61018 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RAB4BP61018 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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RAB4BP61018 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB4BP61018 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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