Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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