Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP4BP1P59074 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP4BP1P59074 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms