Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LOXL3P58215 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms