Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTBP2P56545 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTBP2P56545 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms