Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP7P55210 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASP7P55210 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASP7P55210 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP7P55210 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP7P55210 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP7P55210 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP7P55210 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP7P55210 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP7P55210 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP7P55210 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASP7P55210 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASP7P55210 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASP7P55210 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms