Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATN1P54259 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATN1P54259 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATN1P54259 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATN1P54259 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATN1P54259 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATN1P54259 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATN1P54259 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATN1P54259 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATN1P54259 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATN1P54259 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATN1P54259 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATN1P54259 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATN1P54259 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATN1P54259 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATN1P54259 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATN1P54259 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATN1P54259 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATN1P54259 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms