Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK4P51957 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK4P51957 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK4P51957 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK4P51957 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK4P51957 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEK4P51957 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NEK4P51957 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEK4P51957 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEK4P51957 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEK4P51957 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NEK4P51957 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms