Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB9AP51151 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB9AP51151 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms