Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCT4P50991 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCT4P50991 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT4P50991 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT4P50991 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT4P50991 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CCT4P50991 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCT4P50991 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCT4P50991 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCT4P50991 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms