Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFBP49765 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFBP49765 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms