Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PRIM1P49642 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIM1P49642 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms