Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCLCP48506 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCLCP48506 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCLCP48506 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCLCP48506 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCLCP48506 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCLCP48506 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCLCP48506 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCLCP48506 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCLCP48506 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLCP48506 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLCP48506 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLCP48506 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLCP48506 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLCP48506 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLCP48506 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLCP48506 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCLCP48506 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GCLCP48506 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCLCP48506 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCLCP48506 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms