Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTRNP46939 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTRNP46939 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTRNP46939 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UTRNP46939 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UTRNP46939 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UTRNP46939 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UTRNP46939 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UTRNP46939 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UTRNP46939 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms