Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRATP43155 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRATP43155 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRATP43155 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRATP43155 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRATP43155 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRATP43155 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRATP43155 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms