Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZEB1P37275 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZEB1P37275 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms