Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LTBRP36941 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LTBRP36941 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LTBRP36941 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LTBRP36941 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LTBRP36941 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LTBRP36941 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms