Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNA7P36544 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms