Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF2P35227 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms