Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKARP32238 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKARP32238 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCKARP32238 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms