Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AADACP1-203ENST00000471766 707 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 CCDC58-205ENST00000479899 545 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 PFDN1-201ENST00000261813 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AP000941.1-201ENST00000530198 1388 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 VDAC1P12-201ENST00000451853 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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HOXD11P31277 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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HOXD11P31277 TCAIM-208ENST00000444602 1056 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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HOXD11P31277 AL110292.1-201ENST00000550024 477 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC106733.1-201ENST00000624476 1038 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD11P31277 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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