Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGA1P29973 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNGA1P29973 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms