Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF2E2P29084 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms