Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTFRP26992 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms