Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMGB2P26583 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB2P26583 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms