Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMLP26374 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMLP26374 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMLP26374 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMLP26374 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMLP26374 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMLP26374 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMLP26374 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMLP26374 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMLP26374 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMLP26374 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms