Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMO1P25800 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMO1P25800 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LMO1P25800 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMO1P25800 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms